牡丹亭是一种丝竹加锣鼓的独特的江南丝竹演奏形式，仅流传于崇明岛。

牡丹亭起源于清代道光年间，据传是由崇明民间艺人王东阳首创，他受南京秦淮河上彩船中乐手边行边演奏场面的启发，制作了亭样牌楼仿船首，后接绢布做成的布篷长廊仿彩船，用竹杆分格由10人撑起，头尾各有一条彩色绳索由人牵引，乐手在布篷长廊下边行边演奏。这种演奏形式被王东阳称为“旱船乐”。后来有一友人送王东阳一幅题为“国色天香数花魁”的牡丹图，王东阳想牡丹被人们誉为花王、花魁，“旱船乐”为别处所无，应当是乐中魁首，再联想到明朝汤显祖写的《牡丹亭》中杜丽娘与柳梦梅生死相恋的故事，曾倾倒过不少人，于是就将“旱船乐”改称为“牡丹亭”。

早期的“牡丹亭”主要演奏民间乐曲《老老板》、《花老板》、《苏合》、《扬合》、《淮王》等，为更适应庙会、行街等喜庆热闹场面，王东阳又加入了崇明民间锣鼓演奏。后又将民间乐曲《苏合》、《扬合》改编成《苏桥》、《扬桥》，乐曲嵌入崇明民间锣鼓连接，该曲称为《苏扬桥》，是目前唯一的江南丝竹锣鼓曲。“牡丹亭”演奏人员后来固定为16人，由八粗（打击乐器）八细（丝竹乐器）组成。

2008年6月，国务院公布江南丝竹为第二批国家级非物质文化遗产名录